Особенностью Интеллектуальных школ является наличие современных, комфортабельных общежитий на 132 мест, отвечающих высоким нормам жизнедеятельности и безопасности людей. Спальный блок состоит из комнат, рассчитанных на 4 ученика, с санузлом и душевой.
Действует Совет учащихся, являющийся органом ученического самоуправления. На совете воспитателей, который проводится ежеквартально, под рубрикой «Голос ученика» заслушиваются предложения/запросы учащихся.
В соответствии с правилами организации деятельности общежитий Назарбаев Интеллектуальных школ, утвержденными решением правления АОО НИШ от «11» июня 2020 года (протокол №23) с внесенными изменениями в соответствии с решением правления АОО НИШ от 6 августа 2021 года, протокол№40, общежития осуществляют следующие задачи:
1) обеспечивают комфортные и безопасные условия проживания учащихся в общежитии;
2) создают условия для получения образования, развития интеллектуальных, творческих, духовных и физических способностей учащихся, формирования прочных основ нравственности и привычки здорового образа жизни;
3) организуют эффективное взаимодействие и сотрудничество с родителями для обеспечения полноценного развития учащегося.